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薬学と薬物設計（20論文）
A comparative study of disintegration actions of various disintegrants using Kohonen's self-organizing maps
Onuki, Y., Kosugi, A., Hamaguchi, M., Marumo, Y., Kumada, S., Hirai, D., ... & Hayashi, Y. (2018). Journal of Drug Delivery Science and Technology, 43, 141-148.
この論文の目的は、医薬錠剤および崩壊剤粉末の崩壊作用をよりよく理解することです。 この目的のために、異なる実験条件下での吸水および崩壊の実験データをViscovery SOMineを用いて分析しています。
Optimization of premix powders for tableting use
Todo, H., Sato, K., Takayama, K., & Sugibayashi, K. (2018). Chemical and Pharmaceutical Bulletin, c18-00213.
この論文では、直接圧縮打錠のための予備混合粉末の組成が最適化されています。 Viscovery SOMineは、実験データに基づいて、全体最適とその信頼区間を推定するブートストラップ再サンプリング手法に使用されました。
Membrane microdomain structures of liposomes and their contribution to the cellular uptake efficiency into HeLa cells
Onuki, Y., Obata, Y., Kawano, K., Sano, H., Matsumoto, R., Hayashi, Y., & Takayama, K. (2016). Molecular pharmaceutics, 13(2), 369-378.
リポソームの膜ミクロドメイン構造とそれらの細胞取り込み効率との関係を分析しています。 Viscovery SOMineを使用して、微細構造のプロパティの5つの異なるクラスターが見つかりました。
Effect of surfactants and thickeners on the stability of menthol–diphenhydramine cream identified by magnetic resonance imaging
Onuki, Y., Yokokawa, M., Utsumi, S., Obata, Y., Machida, Y., Seike, C., ... & Takayama, K. (2016). Chemical and Pharmaceutical Bulletin, 64(11), 1616-1621.
この論文の目的は、相分離を懸念せずにメントール - ジフェンヒドラミンクリームの安定した製剤を見出すことです。 Viscovery SOMineを用いた探索的分析により、界面活性剤の効果を安定化させるための親水性 - 親油性バランスが重要な因子であることが明らかにされ、さらに、所望の安定性を得るためには増粘剤を使用しなければならないことがわかりました。
Application of artificial neural network to investigate the effects of 5-fluorouracil on ribonucleotides and deoxyribonucleotides in HepG2 cells
Guo, J., Chen, Q., Lam, C. W. K., Wang, C., Wong, V. K. W., Xu, F., ... & Zhang, W. (2015). Scientific reports, 5, 16861.
この研究は、HepG2細胞におけるヌクレオチドに対する抗癌剤5-フルオロウラシルの効果を分析しています。 処理された細胞と未処理の細胞とを比較することにより、Viscovery SOMineクラスターモデルは、デオキシリボヌクレオチドに対する種々の効果を明らかにしました。
Self-organizing map analysis for understanding comprehensive relationships between formulation variables, state of water, and the physical stability of pharmaceutical emulsions
Onuki, Y., Hasegawa, N., Horita, A., Ueno, N., Kida, C., Hayashi, Y., ... & Takayama, K. (2015). Chemical and Pharmaceutical Bulletin, 63(11), 901-906.
医薬エマルションの物理的安定性は、製剤中の界面活性剤含量、含水量および親水性 - 親油性バランスに関して分析されています。 これらの乳剤のViscovery SOMineモデルは、4つのクラスタを示し、安定した溶液の分析を可能にします。
Determination of the optimal cell-penetrating peptide sequence for intestinal insulin delivery based on molecular orbital analysis with self-organizing maps
Kamei, N., Kikuchi, S., Takeda‐Morishita, M., Terasawa, Y., Yasuda, A., Yamamoto, S., ... & Takayama, K. (2013). Journal of pharmaceutical sciences, 102(2), 469-479.
インスリンの腸内吸収速度に対する異なる細胞透過性ペプチドの影響を分析しています。 Viscovery SOMineは、ペプチドの分子量、塩基性、最低非占有分子軌道エネルギー、絶対硬度および化学ポテンシャルが吸収に大きな影響を及ぼすという発見を容易にします。
Self-organizing map analysis using multivariate data from theophylline tablets predicted by a thin-plate spline interpolation
Yasuda, A., Onuki, Y., Obata, Y., Yamamoto, R., & Takayama, K. (2013). Chemical and Pharmaceutical Bulletin, 61(3), 304-309.
テオフィリン錠剤は、いくつかの様々な設計パラメータを有する標準的な製剤に基づいて調製されます。 Viscovery SOMineは、設計パラメータと薬学的応答（引張強度および安定性、崩壊時間および安定性）との間の関係を分析するために使用されています。
Contribution of the physicochemical properties of active pharmaceutical ingredients to tablet properties identified by ensemble artificial neural networks and Kohonen's self-organizing maps
Onuki, Y., Kawai, S., Arai, H., Maeda, J., Takagaki, K., & Takayama, K. (2012). Journal of pharmaceutical sciences, 101(7), 2372-2381.
この論文は、硬度および崩壊時間などの錠剤特性に対する活性医薬成分の寄与を分析しています。 この目的のために、プラセボ錠剤のための最適なベース製剤が計算されます。 続いて、この基本配合物を用いて活性医薬成分を含む錠剤を調製し、Viscovery SOMineを用いて錠剤の物理化学的性質を整理し、錠剤特性に対する影響の分布を分析しています。
Reliability evaluation of the design space of the granulation process of mefenamic acid tablets using a bootstrap resampling technique
Arai, H., Suzuki, T., Yada, S., Kaseda, C., Onuki, Y., & Takayama, K. (2011). Chemical and Pharmaceutical Bulletin, 59(5), 608-617.
メフェナミン酸錠剤は、溶解時間、硬度および顆粒サイズに関して最適化されます。 Viscovery SOMineは、設計空間の視覚化とクラスタリングに使用されます。
Latent structure analysis in pharmaceutical formulations using Kohonen’s self-organizing map and a Bayesian network
Kikuchi, S., Onuki, Y., Yasuda, A., Hayashi, Y., & Takayama, K. (2011). Journal of pharmaceutical sciences, 100(3), 964-975.
この論文では、塩酸ジルチアゼムを含む親水性マトリックス錠剤のデザインスペースを視覚化しています。 Viscovery SOMineは、ポリマー溶液の濁度および粘度ならびに溶解時間などの様々な応答変数の分布を分析するために使用されます。
A statistical approach to the development of a transdermal delivery system for ondansetron
Obata, Y., Ashitaka, Y., Kikuchi, S., Isowa, K., & Takayama, K. (2010). International journal of pharmaceutics, 399(1-2), 87-93.
オンダンセトロンヒドロゲルは、皮膚浸透性、皮膚刺激の欠如および薬理学的効果に関して最適化されます。 Viscovery SOMineは、設計スペースで最適なソリューションを視覚化し、トレードオフ解析を実行するために使用されます。
Role of individual test samples in optimal solutions in pharmaceuticals predicted using a nonlinear response surface method
Onuki, Y., Kikuchi, S., Yasuda, A., & Takayama, K. (2010). International journal of pharmaceutics, 396(1-2), 75-82.
本論文では、非線形応答表面法、ブートストラップサンプリング法、自己組織化マップ可視化法を用いて、光架橋ポリアクリル酸ハイドロゲルの最適化について述べています。 Viscovery SOMineは、類似した解のクラスタを見つけ、ローカルミニマムとその直接の近傍を比較するために使用されます。
Phase behavior in a ternary lipid membrane estimated using a nonlinear response surface method and Kohonen’s self-organizing map
Onuki, Y., & Takayama, K. (2010). Journal of colloid and interface science, 343(2), 628-633.
異なる脂質組成を有する三成分脂質膜の相挙動を分析する。 Viscovery SOMineは、異なる温度で観測された異方性に関して準備された膜をクラスタリングするために使用されています。
Reliability assessment for the optimal formulations of pharmaceutical products predicted by a nonlinear response surface method
Kikuchi, S., & Takayama, K. (2009). International journal of pharmaceutics, 374(1-2), 5-11.
医薬用軟膏、エマルジョンおよび分散液の特性は最適化されています。 Viscovery SOMineは、設計空間を視覚化し、ブートストラップ再サンプリングを使用して非線形応答表面法によって生成された最適解を検証するために使用されます。
Phytochemical informatics of traditional Chinese medicine and therapeutic relevance
Ehrman, T. M., Barlow, D. J., & Hylands, P. J. (2007). Journal of chemical information and modeling, 47(6), 2316-2334.
この研究では、現代の植物化学分類に関してViscovery SOMineによって240の漢方薬から8411種類の化合物が集められています。 得られたクラスタは、伝統的な漢方薬分類と比較され、薬理学的特性と中国医学の伝統的言語との関連を明らかにしています。
Evaluation of the reliability of nonlinear optimal solutions in pharmaceuticals using a bootstrap resampling technique in combination with Kohonen’s self-organizing maps
Onuki, Y., Ohyama, K., Kaseda, C., Arai, H., Suzuki, T., & Takayama, K. (2008). Journal of pharmaceutical sciences, 97(1), 331-339.
応答面法、ブートストラップサンプリング、自己組織化マップからなる医薬品の多目的最適化のための信頼できる設計手法を紹介しています。 コンセプトの検証として、テオフィリン錠剤は硬度および薬物放出時間に関して最適化されています。 Viscovery SOMineは、局所および全体の最適解を分析して、意思決定のための一貫した候補を見つけるために使用されます。
Sensor combination and chemometric modelling for improved process monitoring in recombinant E. coli fed-batch cultivations
Clementschitsch, F., Jürgen, K., Florentina, P., & Karl, B. (2005). Journal of biotechnology, 120(2), 183-196.
細菌における組換えタンパク質産生の最適化のための重要な目的は、宿主細胞の合成能力の利用を最大限にすることです。 キー変数には信頼できるオンラインセンサがないため、利用可能なオンライン信号を数学的モデルを使用してプロセス変数に関連付ける必要があります。 プロセス変数のケモメトリックモデリングを改善するために、二次元蛍光分光法のための誘電分光法および多波長オンライン蛍光センサを一連の組換え大腸菌流加培養に適用し、2つの異なるプロセス動作状態を適用します。 2つの異なるモデリング技術を用いた主要なプロセス変数の化学的モデリングは、このセンサーの組み合わせが、組換え大腸菌（E.coli）栽培におけるプロセス変数の推定（すなわち、エラーの大きさの低減）を大幅に改善し、それによってプロセスモニタリング能力を向上させることを示しています。
Optimizing recombinant microbial fermentation processes: an integrated approach
Cserjan-Puschmann, M., Clementschitsch, F., & Bayer, K. (2002). BioPharm 15(7): 26-34.
効率を改善し、宿主 - ベクターの利用を最大化し、費用を削減し、製品の一貫性を改善し、製品開発を加速するための組換え遺伝子発現を制御するための新しい戦略が記載されています。 Viscovery SOMineは、プラスミドコピー数推定のモデルを作成するために使用されます。 統合されたアプローチは、工業的規模で組換えタンパク質を生産するため、および標的化されたプロセス最適化のための実験を設計するために有用です。
Optimized data exploration of recombinant fermentations using neural network simulations
Dürrschmid, E., & Bayer, K. (1998). IFAC Proceedings Volumes, 31(8), 393-397.
自己組織化マップと動径基底関数ネットワークの組み合わせは、発酵データに適用される強力なツールとして提示され、相互依存性とそれに続くモデリングの迅速な認識を可能にします。 Viscovery SOMineは、代謝負荷と組換えタンパク質産生との関係、および細胞の合成能力の改善された使用の関係をよりよく理解するために、シグナル分子の出現および濃度をモデル化するために使用されています。
